Odpowiedz w wątku  [ Posty: 2 ] 
ACD/ChemSketch 12 [program] 
Autor Wiadomość

Dołączył(a): 26 maja 2009, o 19:14
Posty: 27
Lokalizacja: Lublin
Post ACD/ChemSketch 12 [program]
Na pewno wszystkim znany jest ten program, bo łatwo można go ściągnąć w wersji freeware i to wystarcza w większości przypadków. Ale pewne limity typu "nazewnictwo tylko dla cząsteczek z max. 50 at. czy 3 pierścieniami" w tym momencie mnie ograniczają, kiedy prowadzę badania nad trochę bardziej skomplikowanymi alkaloidami, ich pochodnymi i wykorzystaniem. Wówczas potrzebna mi jest nazwa dla skomplikowanych cząsteczek, gdzie pierścieni jest np. 6 i są połączone tak, że w 3D z płaskiego wzoru na kartce robi się naprawdę skomplikowana cząsteczka.

Najlepszym wyjściem dla mnie byłaby pełna wersja oprogramowania. Ale zdecydowałem się na 14-dniową wersję demo, tyle by mi wystarczyło, że dodać do pracy potrzebne mi rzeczy. Zarejestrowałem się na I-Lab/ACD, aktywowałem konto, wysłałem prośbę o Demo Key i przyszedł czas na rejestrację klucza. W ChemSketch wg strony powinno to iść tak (nie chcę używać nieporęcznego appletu na Javie): I-Lab > Register Demo Access. Wpisuję swój Login z I-Lab, wpisuję hasło i klucz, który dostałem. Po chwili wyskakuje okno:

Request:
Register at ACD/I-Lab

Reply
[b]Internal I-Lab Error. Contact I-Lab Administrator


Nie mam zamiaru kontaktować się z administratorem, to się powtarza ciągle, odkąd dostałem klucz, czyli od końca kwietnia.

Może coś robię nie tak? Albo w ogóle powinien sobie odpuścić pełną wersję tego oprogramowania i ktoś może mi polecić program, który generuje nazwy IUPAC narysowanej cząsteczki, pokazuje cząsteczkę po wpisaniu nazwy IUPAC (bez limitów, 50 atomów i to takich, a takich + max. 3 pierścienie), z przynajmniej takimi kalkulacjami przynajmniej takimi, które występują w ChemSketch.

Skądś przecież ludzie biorą pełne nazwy IUPAC, wzory SMILES itp. dla bardzo skomplikowanych cząsteczek. Inne oprogramowanie?


11 maja 2010, o 07:48
Zobacz profil
Zasłużony dla forum
Avatar użytkownika

Dołączył(a): 4 mar 2005, o 10:38
Posty: 249
Lokalizacja: Starachowice
Post 
Nie jestem w temacie, zupełny laik, ale przyjrzyj się stronce http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ i narzędziom na niej dostępnym.
Można wprowadzić strukturę w ich edytorze lub np. wygenetować SMILES w np. bkchem i wyszukać na tamtej stronce.
https://www.chemaxon.com/
https://www.chemaxon.com/forum/viewpost12520.html
http://chemnomparse.sourceforge.net/
http://depth-first.com/articles/2006/09 ... emnomparse
http://sourceforge.net/apps/mediawiki/c ... =Main_Page
W repo ubuntu jest kilkadziesiąt ciekawych programów przydatnych chemikom, w tym m.in. BALLView, Avogardo, GROMACS :lol: - być może w czymś pomogą :P
Tu jest też ciekawa choć nie najnowsza lista użytecznych programów:
http://www.redbrick.dcu.ie/~noel/linux4chemistry/


11 maja 2010, o 10:18
Zobacz profil
Wyświetl posty nie starsze niż:  Sortuj wg  
Odpowiedz w wątku   [ Posty: 2 ] 

Kto przegląda forum

Użytkownicy przeglądający ten dział: Brak zidentyfikowanych użytkowników i 19 gości


Nie możesz rozpoczynać nowych wątków
Nie możesz odpowiadać w wątkach
Nie możesz edytować swoich postów
Nie możesz usuwać swoich postów
Nie możesz dodawać załączników

Szukaj:
cron
Multumiri adresate phpBB.com & phpBB.ro..
Design creat de Florea Cosmin Ionut.
© 2011

..