Witam. Czy ktoś może wie jak szybko (bez manualnej modyfikacji kątów i długości wiązań) zmienić konformację cykloheksanu w tym programie? Chodzi mi o opcję typu wyszukiwanie innych tautomerów ,która pokazuje trwałość itd. Cykloheksan po optymalizacji 3D ma konformację skręconej łódki.
28 sty 2015, o 18:16
adam001d
@MODERATOR
Dołączył(a): 1 sty 2010, o 01:56 Posty: 191 Lokalizacja: Łódź
Re: ACD/ChemSketch konformacje cykloheksanu
Nie da się tego szybko zrobić, możesz jedynie próbować różnych sposobów generowania struktury na podstawie kodu SMILES, bądź automatycznej optymalizacji struktury. Bardziej zaawansowanym oprogramowaniem tego typu jest zdecydowanie ChemOffice, gdzie nie będzie takich problemów.
_________________ Przypominam o stosowaniu 2.4.3. punktu regulaminu!
Pisać posty komunikatywne, zgodne z przyjętymi zasadami ortografii i gramatyki. Jak się wkurzę - zacznę wywalać posty.
Nabijania postów też nie lubię, drażnią mnie goście, wcinają się wszędzie nie mając naprawdę nic ciekawego do powiedzenia.
4 lut 2015, o 20:09
zyd
Dołączył(a): 16 wrz 2012, o 11:33 Posty: 32
Re: ACD/ChemSketch konformacje cykloheksanu
Z tego co widzę program nie jest darmowy
5 lut 2015, o 20:23
zyd
Dołączył(a): 16 wrz 2012, o 11:33 Posty: 32
Re: ACD/ChemSketch konformacje cykloheksanu
Jak wygenerować strukturę ze SMILES? Jak na razie poznałem tylko podstawowe funkcje programu
5 lut 2015, o 20:28
adam001d
@MODERATOR
Dołączył(a): 1 sty 2010, o 01:56 Posty: 191 Lokalizacja: Łódź
Re: ACD/ChemSketch konformacje cykloheksanu
Bodajże w menu structure istnieje coś takiego.
_________________ Przypominam o stosowaniu 2.4.3. punktu regulaminu!
Pisać posty komunikatywne, zgodne z przyjętymi zasadami ortografii i gramatyki. Jak się wkurzę - zacznę wywalać posty.
Nabijania postów też nie lubię, drażnią mnie goście, wcinają się wszędzie nie mając naprawdę nic ciekawego do powiedzenia.
5 lut 2015, o 21:01
zyd
Dołączył(a): 16 wrz 2012, o 11:33 Posty: 32
Re: ACD/ChemSketch konformacje cykloheksanu
Z tego co widzę to konformacja zależy od szczęścia. Raz skręcona łódka a raz krzesło. Nie wiem jak ze SMILES otrzymać konkretną konformację ale opcja jest ogólnie bardzo przydatna. Wielkie dzięki za pomoc.
6 lut 2015, o 23:41
adam001d
@MODERATOR
Dołączył(a): 1 sty 2010, o 01:56 Posty: 191 Lokalizacja: Łódź
Re: ACD/ChemSketch konformacje cykloheksanu
Ze SMILES nie wygenerujesz konformacji. SMILES informuje jedynie, jakie atomy występują w cząsteczce, oraz w jaki sposób są ze sobą połączone, nie zawierają informacji o geometrii, to zależy od interpretacji/ustawień programu dekodującego.
_________________ Przypominam o stosowaniu 2.4.3. punktu regulaminu!
Pisać posty komunikatywne, zgodne z przyjętymi zasadami ortografii i gramatyki. Jak się wkurzę - zacznę wywalać posty.
Nabijania postów też nie lubię, drażnią mnie goście, wcinają się wszędzie nie mając naprawdę nic ciekawego do powiedzenia.
Użytkownicy przeglądający ten dział: Brak zidentyfikowanych użytkowników i 19 gości
Nie możesz rozpoczynać nowych wątków Nie możesz odpowiadać w wątkach Nie możesz edytować swoich postów Nie możesz usuwać swoich postów Nie możesz dodawać załączników
